Opis stanowiska
Dyrektor Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego za zgodą Rektora Uniwersytetu Warszawskiego, ogłasza konkurs na stanowisko stażysty podoktorskiego (adiunkta) w grupie pracowników badawczych w Laboratorium Genomiki Funkcjonalnej i Strukturalnej Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego.
Nasze wymagania
- Stopień doktora w dziedzinie matematyki, bioinformatyki, biologii obliczeniowej, informatyki, biostatystyki lub dziedzin pokrewnych.
- Doświadczenie w analizie danych wysokoprzepustowych, w szczególności danych NGS
- doświadczenie w analizie danych Hi-C, HiChIP.
- Bardzo dobra znajomość co najmniej jednego języka programowania wykorzystywanego w analizie danych, np. Python lub R.
- Doświadczenie w pracy w środowisku Linux oraz z narzędziami command-line
- Znajomość metod statystycznych i umiejętność ich praktycznego zastosowania do analizy danych biologicznych.
- Doświadczenie w analizie danych genomowych, epigenomicznych lub transkryptomicznych.
- Umiejętność integracji danych pochodzących z różnych technologii i platform pomiarowych.
- Umiejętność tworzenia czytelnych wizualizacji danych i przygotowywania figur publikacyjnych.
Mile widziane
- doświadczenie w analizie danych ChIP-seq, CUT&RUN, ATAC-seq, IBLESS lub ONT.
- znajomość metod analizy struktury 3D genomu
- doświadczenie w analizach multiomicznych;
- doświadczenie w pracy z klastrami HPC, systemami kolejkowymi i workflow managers, np. Slurm, Nextflow lub Snakemake;
Zakres obowiązków
- Analiza surowych danych NGS, w tym HiChIP, ChIP-seq, CUT&RUN oraz IBLESS.
- Analiza danych Oxford Nanopore Technologies (ONT), z uwzględnieniem profili metylacji i hydroksymetylacji DNA.
- Identyfikacja i charakterystyka różnic pomiędzy badanymi układami eksperymentalnymi w zakresie organizacji przestrzennej chromatyny, wiązania białek, modyfikacji DNA oraz występowania pęknięć dwuniciowych DNA (DSB).
- Analiza statystyczna wyników oraz ocena istotności obserwowanych różnic.
- Integracja i analiza danych multiomicznych.
- Wizualizacja danych genomowych oraz przygotowywanie figur do publikacji i prezentacji.
- Charakterystyka stanów epigenetycznych oraz analiza ich związku z trójwymiarową organizacją genomu.
- Interpretacja wyników w kontekście biologicznym i mechanistycznym.
- Przygotowywanie manuskryptów naukowych i współudział w publikacji wyników badań.
- Udział w przygotowywaniu wniosków grantowych oraz innych dokumentów naukowych.
Oferujemy
- Pracę w interdyscyplinarnym zespole badawczym łączącym biologię molekularną, genomikę, bioinformatykę i analizę danych.
- Udział w nowatorskim projekcie dotyczącym epigenetyki i przestrzennej organizacji genomu
- Pracę z wykorzystaniem nowoczesnych technologii mapowania genomu.
- Dostęp do unikalnych danych multiomicznych oraz infrastruktury obliczeniowej do ich analizy
- Możliwość rozwijania własnych koncepcji badawczych i narzędzi bioinformatycznych.
- Możliwość udziału w konferencjach, szkoleniach, warsztatach oraz zagranicznych stażach i wizytach naukowych.
- Współpracę z krajowymi i międzynarodowymi partnerami naukowymi.
- Możliwość dalszego rozwoju kariery naukowej i budowania samodzielności badawczej.
Dokumenty wymagane do rekrutacji
- List motywacyjny zawierający plan dalszej działalności badawczej.
- Aktualny życiorys
- Kopia dyplomu doktorskiego lub innego dokumentu potwierdzającego, że kandydat uzyska stopień doktora najpóźniej na dzień zatrudnienia w projekcie.
- Kontakt do 2 osób mogących wystawić rekomendacje.
- Lista publikacji naukowych autorstwa lub współautorstwa kandydata.
Załączniki
Dodatkowe informacje dla kandydata
careers@cent.uw.edu.pl z numerem konkursu ‘CeNT-35-2026’ w tytule maila