Opis stanowiska
Osoba zatrudniona na tym stanowisku będzie prowadzić badania w obszarze weryfikacji, testowania i eksploracji modeli sztucznej inteligencji ze szczególnym uwzględnieniem zastosowań w biologii strukturalnej i bioinformatyce. Prace będą koncentrować się na opracowywaniu metod umożliwiających interpretację i kontrolę modeli AI analizujących złożone dane genomowe i epigenomowe oraz dane z symulacji molekularnych.
Nasze wymagania
- Stopień naukowy doktora (lub równoważne doświadczenie badawcze) w dziedzinie matematyki, informatyki, nauk przyrodniczych lub pokrewnej;
- robek publikacyjny w określonej dziedzinie lub dziedzinach.
- Umiejętność samodzielnego prowadzenia badań.
- Od kandydatki/kandydata oczekuje się inicjatywy w rozwiązywaniu problemów badawczych, zaangażowania w realizację zadań projektowych, aktywnego udziału w seminariach i konferencjach naukowych oraz gotowości do przygotowania publikacji i wniosków grantowych dla młodych badaczy.
- Bardzo dobra znajomość j. angielskiego.
Zakres obowiązków
- analiza danych genomowych i epigenomowych (iBLESS, ChIA-PET, ChIA-Drop, Hi-C, HiChIP, ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq);
- modelowanie struktur trójwymiarowych na podstawie danych ChIA-PET, Hi-C i pokrewnych;
- opracowywanie i walidacja modeli AI do predykcji oddziaływań molekularnych, z wykorzystaniem technik dokowania (GLIDE, AutoDock, RxDock, DOCK 6, LeDock, GOLD) i symulacji dynamiki molekularnej (OpenMM i inne);
- rozwijanie i stosowanie metod explainable AI do wyjaśniania mechanizmów interakcji biomolekularnych;
- integracja wyników AI z wiedzą biofizyczną i statystyczna analiza hipotez wynikających z symulacji;
- opracowywanie eksperymentów benchmarkingowych oraz udział w interpretacji i publikacji wyników.
Dokumenty wymagane do rekrutacji
- podanie do prorektora ds. ogólnych;
- życiorys;
- kwestionariusz osobowy dla kandydata;
- kopie dyplomu ukończenia studiów wyższych i uzyskanie tytułu zawodowego magistra lub tytułu równorzędnego;
- odpis dyplomu doktorskiego
- wykaz dorobku naukowego i organizacyjnego
- inne dokumenty potwierdzające posiadanie dodatkowych kwalifikacji;
- oświadczenie o uznaniu PW jako podstawowego miejsca pracy, w rozumieniu ustawy - Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce;
- oświadczenie o pełnej zdolności do czynności prawnej,
- oświadczenie o korzystaniu z pełni praw publicznych,
- oświadczenie o nieskazaniu prawomocnym wyrokiem za umyślne przestępstwo lub umyślne przestępstwo skarbowe,
- oświadczenie o nieukaraniu karą dyscyplinarną, o której mowa w art. 276 ust. 1 pkt 7 i 8 ustawy;
Załączniki
Dodatkowe informacje dla kandydata
Więcej o projekcie można przeczytać na stronie projektu http://credibleai.eu/