Opis stanowiska
Osoba zatrudniona na tym stanowisku będzie prowadzić grupę badawczą w obszarze weryfikacji, testowania i eksploracji modeli sztucznej inteligencji ze szczególnym uwzględnieniem zastosowań w biologii strukturalnej i bioinformatyce. Prace będą koncentrować się na opracowywaniu metod umożliwiających interpretację i kontrolę modeli AI analizujących złożone dane genomowe i epigenomowe oraz dane z symulacji molekularnych.
Od kandydatki/kandydata oczekuje się samodzielności, inicjatywy w rozwiązywaniu problemów badawczych, zaangażowania w realizację zadań projektowych, aktywnego udziału w seminariach i konferencjach naukowych oraz gotowości do przygotowania publikacji i wniosków grantowych dla młodych badaczy.
Lider Zespołu Badawczego – należy przez to rozumieć naukowca pełniącego obowiązki lidera grupy badawczej w Jednostce realizującej MAB odpowiedzialnego za prace merytoryczne danego zespołu.
Nasze wymagania
- posiadanie stopnia naukowego doktora (lub równoważne doświadczenie badawcze) w dziedzinie w dziedzinie matematyki, informatyki, nauk przyrodniczych lub pokrewnej;
- dorobek publikacyjny w określonej dziedzinie lub dziedzinach;
- umiejętność samodzielnego prowadzenia badań;
- od kandydatki/kandydata oczekuje się inicjatywy w rozwiązywaniu problemów badawczych, zaangażowania w realizację zadań projektowych, aktywnego udziału w seminariach i konferencjach naukowych oraz gotowości do przygotowania publikacji i wniosków grantowych dla młodych badaczy;
- bardzo dobra znajomość języka angielskiego.
Zakres obowiązków
- prowadzenie grupy badawczej zgodnie z wnioskiem i agendą badawczą MAB
- analiza danych genomowych i epigenomowych (iBLESS, ChIA-PET, ChIA-Drop, Hi-C, HiChIP, ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq);
- modelowanie struktur trójwymiarowych na podstawie danych ChIA-PET, Hi-C i pokrewnych;
- opracowywanie i walidacja modeli AI do predykcji oddziaływań molekularnych, z wykorzystaniem technik dokowania (GLIDE, AutoDock, RxDock, DOCK 6, LeDock, GOLD) i symulacji dynamiki molekularnej (OpenMM i inne);
- rozwijanie i stosowanie metod explainable AI do wyjaśniania mechanizmów interakcji biomolekularnych;
- integracja wyników AI z wiedzą biofizyczną i statystyczna analiza hipotez wynikających z symulacji;
- opracowywanie eksperymentów benchmarkingowych oraz udział w interpretacji i publikacji wyników.
Dokumenty wymagane do rekrutacji
- Dokumenty według załącznika
Załączniki
Dodatkowe informacje dla kandydata
Oceniamy kompetencje kandydatów na liderów grup badawczych na podstawie:
-jakości i oryginalności do 3 osiągnięć naukowych kandydata (uzyskanych w ostatnich 10 latach) w dziedzinie, w której mają być prowadzone badania w projekcie na tle osiągnięć w tej dziedzinie w najlepszych ośrodkach naukowych na świecie
-doświadczenia kandydata w kierowaniu zespołem badawczym lub jego potencjał do bycia liderem
-doświadczenia w byciu kierownikiem projektu grantowego lub jego wykonawcą
-doświadczenia kandydata w komercjalizacji wyników badań i współpracy z gospodarką
-udziału kandydata w realizacji prac dyplomowych jako promotor lub promotor pomocniczy prac doktorskich
-rezultaty badań naukowych, które kandydat uzyskał w ramach wskazanych we wniosku projektów finansowanych ze źródeł zewnętrznych i zakończonych w okresie ostatnich 3 lat oraz wpływ tych wyników na dziedzinę, której dotyczy agenda badawcza we wniosku
Oferowane wynagrodzenie roczne 255-320 tys PLN brutto finansowane z projektu