Opis stanowiska
Stanowisko obejmuje interdyscyplinarne badania na styku bioinformatyki, genomiki i biologii obliczeniowej w ramach projektu OPUS 27 w Instytucie Zoologii i Badań Biomedycznych UJ. Badania koncentrują się na analizie różnorodności fenotypowej twarzoczaszki człowieka przy użyciu zaawansowanych danych genomicznych i epigenomicznych. Główne obowiązki obejmują: analizę bioinformatyczną danych wielkoskalowych, rozwój klasyfikatorów genomicznych (modeli predykcyjnych) dla fenotypów twarzy, wykorzystanie algorytmów uczenia maszynowego oraz przetwarzanie dużych zbiorów danych WGS i mikromacierzy DNA. Kandydaci powinni posiadać stopień doktora w dziedzinie bioinformatyki lub pokrewnej, mieć silne umiejętności obliczeniowe oraz doświadczenie w analizie danych genomicznych i metodach uczenia maszynowego. Oferujemy stabilne zatrudnienie, dostęp do nowoczesnej infrastruktury badawczej,współpracę z renomowanym zespołem interdyscyplinarnym oraz możliwości rozwoju zawodowego i publikacji w czasopismach
Nasze wymagania
- posiadanie co najmniej stopnia doktora,
- posiadanie odpowiedniego dorobku naukowego,
- czynny udział w życiu naukowym.
- stopień doktora w dziedzinie bioinformatyki, genetyki, biologii obliczeniowej, biologii molekularnej, biotechnologii lub pokrewnej uzyskany nie wcześniej niż 7 lat przed 1 stycznia roku zatrudnienia w projekcie,
- uzyskanie stopnia doktora w podmiocie innym niż UJ lub odbycie co najmniej 10-miesięcznego, ciągłego i udokumentowanego stażu podoktorskiego zagranicznego,
- doświadczenie w pracy z danymi (epi)genomicznymi, szczególnie WGS, mikromacierzy DNA,
- doświadczenie w przetwarzaniu dużych zbiorów danych,
- znajomość metod uczenia maszynowego,
- publikacje w renomowanych czasopismach, w szczególności w obszarze genetyki, biologii obliczeniowej i bioinformatyki,
- dobra znajomość języka programowania,
- umiejętność pracy z narzędziami do wizualizacji danych i raportowania wyników,
- zdolność do pracy w zespole interdyscyplinarnym i samodzielność w realizacji zadań badawczych.
Zakres obowiązków
- analiza danych genomicznych i epigenomicznych, w tym danych z sekwencjonowania całego genomu (WGS) i mikromacierzy DNA (Infinium GSA, Infinium MethylationEPIC);
- identyfikacja wariantów genetycznych i epigenetycznych związanych z wyglądem twarzy, w tym rzadkich wariantów genetycznych;
- praca z dużymi zbiorami danych przy użyciu zaawansowanych narzędzi bioinformatycznych;
- opracowanie i wdrożenie klasyfikatorów genomicznych umożliwiających predykcję wyglądu twarzy na podstawie markerów genetycznych i epigenetycznych;
- testowanie różnych metod modelowania predykcyjnego, w tym uczenia maszynowego (np. sieci neuronowe);
- implementacja i optymalizacja algorytmów do predykcji cech fenotypowych, takich jak kształt twarzy, pigmentacja skóry, wiek, płeć i BMI;
- walidacja opracowanych klasyfikatorów (modeli predykcyjnych) na podstawie danych zebranych w ramach projektu;
- ocena dokładności klasyfikacji fenotypu na podstawie rzeczywistych danych fenotypowych i genotypowych;
- współpraca z zespołem przy analizie danych fenotypowych, w tym danych 3D uzyskanych z tomografii komputerowej i skanów twarzy.
Oferujemy
- stabilne zatrudnienie w oparciu o umowę o pracę, w uznanej uczelni,
- współpracę z interdyscyplinarnym środowiskiem naukowym reprezentowanym przez uznanych naukowców,
- wsparcie naukowe i możliwość podnoszenia kwalifikacji oraz rozwoju zawodowego,
- dostęp do infrastruktury badawczej,
- benefity w postaci m.in. Karty Multisport, zajęć sportowych, możliwość skorzystania z pakietów medycznych, ubezpieczenia grupowego,
- dodatkowe świadczenia socjalne
- możliwość pracy w interdyscyplinarnym zespole badawczym o uznanej renomie, który był zaangażowany w opracowanie uznanych i wdrożonych w praktyce kryminalistycznej metod predykcji cech fenotypowych,
- dostęp do nowoczesnych technologii i metod badawczych,
- współudział w tworzeniu publikacji naukowych w renomowanych czasopismach oraz prezentacji na międzynarodowych konferencjach,
- stabilne i dostosowane do wysokich kwalifikacji i zapotrzebowania na specjalistów w obszarze bioinformatyki i uczenia maszynowego wynagrodzenie,
- wsparcie administracyjne i organizacyjne związane z realizacją projektu.
Dokumenty wymagane do rekrutacji
- CV
- kwestionariusz osobowy dla osoby ubiegającej się o zatrudnienie
- kopia dyplomu doktorskiego lub doktora habilitowanego - jeżeli Kandydat /Kandydatka posiada,
- informacja o dorobku naukowym, dydaktycznym i organizacyjnym Kandydata /Kandydatki,
- oświadczenie stwierdzające, że UJ będzie podstawowym miejscem pracy w przypadku wygrania konkursu,
- oświadczenie w trybie art. 113 ustawy Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce,
- oświadczenie o znajomości i akceptacji zasad dotyczących zarządzania własnością intelektualną oraz zasad komercjalizacji UJ.
- Druki oświadczeń (nr 5-7) oraz wzór kwestionariusza osobowego (nr 2) można pobrać na stronie: https://cso.uj.edu.pl/pl_PL/dokumkandyd
- Dokumentacja w zakresie posiadanych kwalifikacji