Opis stanowiska

Opis projektu:
Projekt obejmuje analizę genomów współczesnych i kopalnych okazów małych ssaków w celu rekonstrukcji ich historii ewolucyjnych i relacji
filogenetycznych.
Link do opisu projektu:
https://projekty.ncn.gov.pl/opisy/500217-pl.pdf

Nasze wymagania

Do konkursu mogą przystąpić osoby spełniające warunki określone w regulaminie przyznawania środków na realizację zadań finansowanych przez Narodowe Centrum Nauki dla projektu OPUS 20.
Status studenta na uczelniach na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej (na dzień rozpoczęcia realizacji zadań w projekcie)
Motywacja do pracy
Znajomość podstaw genetyki molekularnej, analiz filogenetycznych i analiz z zakresu genetyki populacyjnej
Doświadczenie w pracy z systemem operacyjnym Linux
Znajomość języka angielskiego na poziomie umożliwiającym swobodną komunikację i czytanie ze zrozumieniem literatury specjalistycznej

Zakres obowiązków

Opracowanie bioinformatyczne surowych danych z sekwencjonowania wysokoprzepustowego – kontrola jakości, filtrowanie, mapowanie do sekwencji referencyjnej (przykładowe programy: BWA, Samtools, picard)
Przywoływanie i filtrowanie genotypów (bcftools, ANGSD)
Rekonstrukcja drzew filogenetycznych w oparciu o dane całogenomowe (Astral)
Umieszczenie danych w postaci surowej lub przetworzonej w odpowiednich repozytoriach (ENA, GenBank)
Graficzne opracowanie uzyskanych danych, udział w przygotowaniu publikacji naukowych.

Oferujemy

przyjazne i motywujące środowisko pracy w młodym rozwijającym się zespole
uczestnictwo w ciekawym projekcie wykorzystującym najnowsze techniki badawcze
dostęp do w pełni wyposażonych laboratoriów współczesnego i kopalnego DNA

Dokumenty wymagane do rekrutacji

Życiorys kandydata
List motywacyjny
dokument poświadczający status studenta (należy dostarczyć najpóźniej do dnia rozpoczęcia realizacji zadań w projekcie)
podpisana klauzula informacyjna o ochronie danych osobowych: https://cent.uw.edu.pl/wp-content/uploads/sites/240/2025/02/recruitment_CeNT_rodo.pdf

Dodatkowe informacje dla kandydata

Więcej informacji: https://www.uw.edu.pl/wp-content/uploads/2025/02/cent-14-2025-student-opus-20-baca_DOP.pdf