Opis stanowiska
W ramach tego projektu zostaną wyprowadzone komórki oporne na inhibitory kinazy BRAF. Następnie dane transkryptomiczne pochodzące z komórek wrażliwych i opornych na inhibitory kinazy BRAF zostaną wygenerowane przy użyciu technologii RNA-seq. W celu przeprowadzenia predykcji kombinacji leków, które uwrażliwiają oporne linie, wykorzystane zostaną wyniki analiz transkryptomicznych oraz metoda SynGeNet służąca do szacowania efektu synergii oddziaływania par leków.
Po wybraniu kombinacji leków na podstawie analizy transkryptomu, do ich weryfikacji zostanie wykorzystany szereg technik biologicznych. Po pierwsze, przetestowany zostanie wpływ kombinacji leków na żywotność i indukcję regulowanej śmierci komórkowej w komórkach czerniaka opornych i wrażliwych na inhibitory kinazy BRAF. Ponadto, zostanie sprawdzone czy wybrana kombinacja leków jest w stanie zmniejszyć właściwości migracyjne i inwazyjne komórek czerniaka, które promują postęp choroby.Korelacja danych eksperymentalnych z wynikam.
Nasze wymagania
- ukończenie studiów wyższych i uzyskanie tytułu zawodowego magistra lub tytułu równorzędnego;
- posiadanie stopnia naukowego doktora w dyscyplinie informatyki, biotechnologii lub dyscyplinach pokrewnych;
- bardzo dobra znajomość języka polskiego i języka angielskiego;
- wysoka motywacja do pracy naukowej, samodzielność, kreatywność, dobra organizacja;
- udokumentowany dorobek naukowy w postaci publikacji w czasopismach z listy filadelfijskiej;
- doświadczenie w przynajmniej jednym spośród wymienionych poniżej kierunków badań:
- - doświadczenie w bioinformatycznej analizie danych multiomicznych w szczególności transkryptomicznych
- - umiejętność programowania w języku R.
- - badania z udziałem linii komórkowych
Zakres obowiązków
- prowadzenie badań
Dokumenty wymagane do rekrutacji
- podanie do prorektora ds. ogólnych;
- życiorys;
- kwestionariusz osobowy dla osoby ubiegającej się o zatrudnienie;
- kopie dyplomu ukończenia studiów wyższych i uzyskanie tytułu zawodowego magistra lub tytułu równorzędnego;
- odpis dyplomu doktorskiego;
- wykaz dorobku naukowego, dydaktycznego i organizacyjnego;
- inne dokumenty potwierdzające posiadanie dodatkowych kwalifikacji;
- oświadczenie o uznaniu PW jako podstawowego miejsca pracy, w rozumieniu ustawy - Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce;
Dodatkowe informacje dla kandydata
Dodatkowa możliwość dyscypliny nauk ścisłych i przyrodniczych: nauki chemiczne
Bliższych informacji udziela: Kierownik Projektu: dr hab. inż. Tomasz Kobiela, prof. uczelni, Gmach Technologii Chemicznej,
ul. Koszykowa75, 00-662 Warszawa, pok. 104a, tel.: +48 880 010863, e-mail: tomasz.kobiela@pw.edu.pl